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C型肝炎ウイルス（HCV）、自己免疫性肝炎（AIH）、原発性胆汁性肝硬変（PBC）などの肝硬変疾患における病原性分子経路の特徴はあまり解明されていません。差次的に発現される遺伝子は、多くの場合、疾患の発症において重要です。サプレッション サブトラクティブ ハイブリダイゼーション (SSH) は、差次的に発現される mRNA 転写物を濃縮するゲノムワイドなアプローチです。我々は、SSH と定量的リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応 (RT-PCR) を組み合わせて、肝硬変における差次的遺伝子発現の新しい観察を行うことを目的としました。HCV 肝硬変、AIH 肝硬変、PBC、および非罹患肝組織における肝臓トランスクリプトームを SSH によって検査しました。得られた相補的 DNA (cDNA) クローンは、ドットブロット ハイブリダイゼーションによって示差的発現について再スクリーニングされ、配列決定されました。選択された遺伝子発現は、リアルタイム RT-PCR によって定量化されました。SSH 後、694 個のクローンが差次的遺伝子発現について再スクリーニングされ、そのうち 145 個の配列が決定され、89 個の異なる遺伝子に由来することが判明しました。７つのクローンは、機能が知られていない遺伝子をコードする発現配列タグ（ＥＳＴ）配列のみと相同であった。4 つの遺伝子の上方制御された発現がリアルタイム RT-PCR によって確認されました: すべての形態の肝硬変における膜貫通 4 スーパーファミリー メンバー 3 (テトラスパニン CO-029)、AIH 肝硬変におけるヘッジホッグ相互作用タンパク質 (HIP)、およびキチナーゼ 3-like-1 HCV 肝硬変における (HC gp-39 または ykl-40) およびアルギニン-グルタミン酸リピート (RERE)。RERE 遺伝子多型とスプライス変異体が、検査したすべての組織で観察されました。テトラスパニン CO-029 の上方制御は主に胆管細胞に局在していました。結論として、SSH を主要な発見ツールとして使用して、ヒト肝硬変における差次的な遺伝子発現の新しい観察が行われました。特に、HCV 関連肝疾患における RERE 遺伝子とその産物のさらなる研究が必要です。