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タンパク質のリン酸化はさまざまな細胞機能を調節し、植物の初期発生において重要な役割を果たします。シロイヌナズナ実生におけるタンパク質リン酸化に関するこれまでの研究を補完し拡張するために、非変性条件下でのタンパク質抽出と、ルビスコ除去抽出物中の無傷のリンタンパク質の固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィー（IMAC）濃縮とそれに続く同定を組み合わせる代替アプローチを使用しました。二次元ゲル電気泳動 (2-DE) および液体クロマトグラフィー - タンデム質量分析 (LC-MS/MS) を使用します。ゲル内トリプシン消化と選択したゲルスポットの分析により、144 個のリン酸化ペプチドと残基が同定されました。そのうち、PhosPhAt 4.0 および P3DB シロイヌナズナリン酸化部位データベースでは、18 個のリンペプチドと 8 個のリン酸化サイトのみが見つかりました。同定された 82 個のリンタンパク質の半分以上は、炭水化物代謝、光合成/呼吸、または酸化ストレス応答機構に関与していました。2-DE および LC-MS/MS の前にインタクトなリンタンパク質を濃縮すると、ペプチドレベルの濃縮を利用する方法と比較して、リン酸化スレオニンおよびチロシン残基の検出が向上するようです。これは、2 つのアプローチがリン酸化部位の範囲の点である程度補完的であることを示唆しています。若い実生の結果とシロイヌナズナの成熟葉で以前に得られた結果を比較すると、これらの組織で異なってリン酸化される 5 つのタンパク質が特定され、植物の発育中のタンパク質のリン酸化の動態を調査するためのこの技術の可能性が実証されました。