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これは有機合成の中間体として使用され、製薬産業ではスルホンアミドであるスルファメトシンを製造するために使用されます。4,6-ジヒドロキシピリミジンは、ビタミン B4、抗腫瘍剤、アジュバント薬の中間体でもあります。