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β-グルカナーゼは、細胞壁の修飾の研究や炭水化物の加水分解に使用されます。これは、家禽に大麦ベースの食事を補うため、またポプルス種の信号導管の再開と休眠状態の解除を研究するために使用されてきました。

β -グルカナーゼは、エネルギーケーンからリグノセルロース系エタノールを生産するための生物学的および化学的前処理方法を組み合わせたセルラーゼ酵素として使用されました。セルロースの酵素糖化やエタノールの製造にも使用されました。